En 1987 ejerce de montador y ayudante de dirección en el documental "Crónica de la segunda guerra carlista" de José María Tuduri (trabajo que le inspirará el guión de "Vacas") y rueda su segundo corto "Las seis en punta" de marcado carácter experimental. En 1988 rueda el mediometraje "Martín" producido por Elías Querejeta dentro de un ciclo de cortos promovido por el productor bajo el título "7 huellas 7".

En 1992 estrena su primer largometraje "Vacas", con el gana el Goya al mejor director novel además de una buena lista de premios internacionales entre los que destaca el Gran Premio Cine Joven del Festival de Tokio de 1992. En la primavera del año 1993 estrena "La ardilla roja", su segundo largometraje, con el que logra un premio en el Festival de Cannes, además de otros importantes galardones.

Con "Tierra" (1996) participa en la Sección Oficial del Festival de Cannes y prosigue su lista de premios al tiempo que su número de seguidores va creciendo. Con "Los amantes del Círculo Polar" (1998) consigue un gran éxito de crítica y conectar con el gran público.

En 2001 confirma su estatus de reconocido cineasta con "Lucía y el sexo", película con la que, no sólo consigue una larga lista de premios internacionales, sino que aúna el éxito de crítica y público, convirtiéndose en el director de cine más personal de España que consigue además encontrarse entre los más taquilleros.