Manuals and HowTo's : Como aplicar el tema de escritorio a las aplicaciones en Ubuntu
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El escritorio de Linux Ubuntu es muy personalizable y el hecho de que sea código libre nos permite darle muchos retoques.
La manera más fácil de personalizar nuestro escritorio es instalando nuevos temas e iconos, una vez tenemos el escritorio a nuestro gusto el problema surge cuando ejecutamos un programa que requiera derechos de administrador, como por ejemplo el gestor de paquetes Synaptic.
Al abrirse su apariencia es muy distinta a la de nuestro escritorio personalizado y esto puede quedar un poco feo, el problema es que las aplicaciones que se ejecutan en modo administrador usan el tema fijado para el usuario root.
 
Una opción sencilla es indicarle a las aplicaciones que ejecutemos como administrador el tema de escritorio que deben usar, para ello pulsaremos Alt. + F2. En el recuadro Ejecutar una aplicación introducimos

gksu ln -sf /home/nombre_usuario/.themes /root/

y pulsa el botón Ejecutar.

Luego repetimos la operación y esta vez introducimos:

gksu ln -sf /home/nombre_usuario/.icons /root/

La próxima vez que ejecutemos cualquier aplicación que requiera permisos de administrador se utilizará nuestro tema personalizado.

Otra solución alternativa es copiar los temas al directorio de temas e iconos de tu distribucion (en mi caso para gnome sería /opt/gnome/share/themes). Así los puede usar cualquier usuario y te evitas el que estén repetidos en dos cuentas distintas (la tuya y la de root).

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